Odborníci zvuk analyzovali a zjistili, že nevznikl bitím předmětů o trup ponorky, jak spekulovala některá média. Zdroj zvuku, který záchranáři zaznamenali asi 360 kilometrů od jihovýchodního pobřeží Argentiny v hloubce zhruba 200 metrů, byl podle Balbiho zřejmě "biologický".

Při poslední komunikaci s námořní základnou ve středu hlásila ponorka ARA San Juan technické potíže. Proto dostala pokyn, aby se vrátila nejkratší cestou do přístavu Mar del Plata.

Podle mluvčího záchranářů, kterého citoval list Clarín, nelze říci, jak dlouho posádka vydrží se vzduchem, jelikož není jasné, jakou má plavidlo přesně poruchu. Za normálních okolností taková ponorka vyplouvá jednou denně na hladinu, aby doplnila kyslík a nabila baterie. Pokud ale byla nucena zůstat pod hladinou, mohou posádce v případě nejhoršího scénáře zbývat jen dva dny.