Muzikolog Bek se stal poprvé rektorem v září 2011, kdy vystřídal po druhém funkčním období Petra Fialu, nynějšího předsedu ODS. Tehdy se o zvolení do čela univerzity ucházelo pět kandidátů, nejvážnějším Bekovým konkurentem byl Ladislav Janíček.
Bek se řízení univerzity ujal po několikaleté zkušenosti z působení v pozici prorektora pro strategii a vnější vztahy. Vedl taktéž Ústav hudební vědy Filozofické fakulty Masarykovy univerzity.
Jako vysokoškolský pedagog pracoval Bek i na Univerzitě Karlově v Praze a Univerzitě Palackého v Olomouci. Ve své vědecké činnosti se zaměřuje na hudební sociologii a dějiny novější hudby 19. a 20. století.
Rektora volí tajným hlasováním akademický senát univerzity, který má nyní 50 členů, z toho 20 studentů. Pro zvolení kandidáta musejí být přítomny nejméně dvě třetiny všech senátorů a s návrhem musí souhlasit nadpoloviční většina všech členů senátu.
Zvoleného kandidáta musí ještě následně jmenovat prezident republiky. S Milošem Zemanem, současnou hlavou státu, měl Bek v minulosti rozpory. V roce 2013 Zemanovi neumožnil vystoupit před studenty univerzity. Jako důvod uvedl blížící se volby. Prezident Beka následně dvakrát nepozval na oslavy 28. října.
