Jak už jsem informovali, z vyšetřování FBI vyplynulo, že na palubě každého z unesených letadel bylo tři až šest teroristů. CNN uvedla, že dalších nejméně 50 osob pomáhalo útok zinscenovat. Šéf FBI Robert Mueller prohlásil, že přestože někteří z únosců již byli identifikováni, nikdo nebyl dosud zatčen. Vyšetřování útoku je označováno za největší akci v americké historii – nasazeno je 7000 agentů FBI. Agenti se soustředí na prozkoumávání domů a podniků na Floridě, které by mohly mít nějakou souvislost s útoky. Pozornost věnují i letecké škole, v níž dva podezřelí patrně absolvovali letecký výcvik. Americké úřady dali rovněž letištnímu personálu v Mexiku k dispozici popis šesti podezřelých. Policie v Thajsku na žádost CIA rovněž zahájila pátrání po 15 podezřelých Arabech.FBI má hlídky na místech, kde startovala a měla přistát unesená letadla. Na pátrání spolupracuje 4000 speciálních agentů, 3000 členů pomocného personálu a více než 400 zaměstnanců laboratoří.Na svých internetových stránkách uveřejnila FBI formulář, který mohou lidé použít v případě, že mohou poskytnout jakékoli informace týkající se úterního útoku. Americký ministr spravedlnosti John Ashcroft rovněž uvedl, že mají "věrohodné informace" o tom, že i Bílý dům a letadlo prezidenta George Bushe měly být cíly útoků. To vysvětluje Bushův úterní opožděný přílet do Washingtonu.