O Baudyšovi krátce po jeho smrti promluvil jeho syn, Antonín Baudyš mladší. „Věděli jsme, že si s mámou příliš nerozumí, jakkoliv máma byla za život s ním vděčná. Žárlil na máminu hlubokou společenskou ozvěnu, kdežto on byl ve stejné době navzdory svým výjimečným schopnostem a lidským kvalitám za mediálně trpěného blba,“ napsal Baudyšův syn.
Tátu, který 24. srpna 2010 podlehl rakovině mozku, bez uzardění obvinil i z řady nevěr. „Táta moji mámu porůznu podváděl, takový úspěch, jaký měl posledních dvacet let u žen, si lze představit jen v nejdivočejších mužských představách,“ tvrdil Baudyš mladší. Zuzana Baudyšová(69), dlouholetá šéfka nadace Naše dítě, o tom prý nevěděla.
Baudyš se během své nemoci, kdy musel podstoupit řadu operací mozku, po 44 letech s manželkou Zuzanou rozvedl, a tři měsíce před smrtí se oženil s milenkou Pavlínou. Teprve u té prý nalezl pochopení pro svou složitou povahu.
Zuzana Baudyšová: Její těžké dětství jí dovedlo až k založení Linky bezpečí