Razantní krok ve vzhledu udělala herečka Nixon kvůli roli v divadle Samuela J. Friedmana. Hra je jejímu srdci blízká. Sama v roce 2006 zjistila, že má rakovinu prsu v počáteční fázi. Zažila lumpektomii (vynětí nádoru z prsu) i chemoterapii. Doteď Cynthia užívá lék Tamoxifen, jenž by ji měl před dalším útokem nemoci ochránit.
Cynthia Nixon se v talkshow rozpovídala i o svém lesbickém vztahu s Christine Marinoni. Herečka žila i patnáct let s Dannym Mozesem, s nímž má dvě děti - Samanthu (15) a Charlieho (9). S Christine nyní vychovávají syna Maxe (1). "Stát se lesbou byla moje volba. I když se homosexuálové proti tomu tvrzení ohrazují, já říkám, že jsem si to zvolila," vypověděla.
