Na třetím místě se v Praze umístil diplomat Pavel Fischer s 13,53 procenta hlasů, čtvrtý skončil textař a podnikatel Michal Horáček s 11,16 procenta hlasů a pátý lékař Marek Hilšer, kterému voliči dali 9,42 procenta hlasů.

V několika pražských okrscích se výsledné pořadí kandidátů liší. V Praze 1 prezident Zeman skončil s 14,65 procenta hlasů až třetí, předstihl jej Fischer s 15,82 procenta. Stejné pořadí jako v Praze 1 výsledky ukázaly i v Křeslicích a Troji. V Královicích pak prezident Zeman porazil Drahoše.

Výsledky za okrsek v Praze Bohnicích, který byl ve 20:00 zpracován jako poslední v ČR, ukázal 100,91 procenta odevzdaných hlasů. Počet odevzdaných hlasů tam o pět převyšoval počet odevzdaných obálek. Český statistický úřad na nesrovnalost upozornil volební komisi, podle ní ale příčinu chyby nelze zpětně dohledat. ČTK to sdělila mluvčí ČSÚ Petra Báčová. Jde o volební okrsek s číslem 8089 s volební místností v Základní škole Ústavní. V okrsku zvítězil Miloš Zeman s 34,29 procenta před Jiřím Drahošem s 31,59 procenta.

V hlavním městě hlasovalo 67,56 procenta voličů, o budoucím prezidentovi mohlo tentokrát v Praze rozhodovat téměř 920.000 lidí. Nejnižší účast byla v Praze 14 s 62,13 procenta, naopak nejvyšší byla v Přední Kopanině - 83,46 procenta. Před pěti lety byla účast voličů v Praze v prvním kole nižší, činila 65,1 procenta.